同濟大學(xué)有關(guān)方面表示，楊杰的行為背離了一個教育工作者和學(xué)者基本的科學(xué)精神和誠信操守，違反了學(xué)校和教育部有關(guān)規(guī)章制度，根據(jù)同濟大學(xué)與其簽訂的聘用合同的有關(guān)條款，學(xué)校決定終止與楊杰的聘用合同，并同時解除對其同濟大學(xué)教授職務(wù)的聘任。

楊杰于2004年9月通過公開招聘，被任命為同濟大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院院長、教授。2006年3月21日，同濟大學(xué)表示因楊杰在學(xué)科建設(shè)、行政管理等方面不適合擔(dān)任院長等行政職務(wù)，正式免去其院長等職務(wù)。

早在2004年10月，方舟子就在他的博客上發(fā)表了《神秘的同濟大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院新院長》一文，質(zhì)疑楊杰履歷造假，在網(wǎng)上引起了較大反響。

同濟大學(xué)在收到反映楊杰涉嫌學(xué)術(shù)造假的舉報后，經(jīng)查證，楊杰確實存在以下造假行為：

2005年3月，在有關(guān)博士點申報材料中，一篇2004年發(fā)表于《肺癌》（Lung Cancer）雜志的論文被列入楊杰作為第一作者的論文清單。經(jīng)查證，該論文并非楊杰的成果。文獻檢索所顯示的“J．Yang”，不是“Jie Yang”，而是“Jun Yang”。楊杰在《肺癌》雜志刊出的論文是在填寫申報材料之后，而且楊杰是第二作者。

2005年7月，楊杰在申報長江學(xué)者特聘教授候選人的申請材料中，再一次將Jun Yang 在《Lung Cancer》上發(fā)表的論文列入自己的成果清單。

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